Dodávka tovaru k projektu: Zavedenie a štandardizácia technológie vyšetrenia genetických predispozícií k zriedkavým dedičným nádorovým ochoreniam pomocou masívneho paralelného sekvenovania

Funkčná špecifikácia

1. Sekvenačný kit pre platformu NGS, masívne paralelné sekvenovanie.; 2. PCR plasty; 3. Prístroj na fragmentáciu DNA

Technická špecifikácia textová

Technické vlastnosti: 1. Sekvenačný kit pre platformu NGS, masívne paralelné sekvenovanie. Diagnostický certifikovaný set pre detekciu mutácií v onkomarkeroch na platforme NGS, 8 testov. CE IVD certifikácia Jedna vzorka - jedna skúmavkaDetekcia sekvenačných variant v BRCA1 a BRCA2 génoch. BRCA1- determinácia celej sekvencie 24 kódujúcich exónov . BRCA2 - determinácia celej sekvencie 27 kódujúcich exónov. Validácia pre rôzny biologický materiál - FFPE bločky, genomická DNA izolovaná z krvi., Hodnota / charakteristika: Uniformita: 99,9 % Analytická špecificita: >99,9 % Klinická senzitivita: >99 % ; Technické vlastnosti: 1. Sekvenačný kit pre platformu NGS, masívne paralelné sekvenovanie. Set musí obsahovať:BRCA mix, Start, Dilution buffer, Index mix, Index strip A2, Index buffer, Sealer S, Library clean.Set obsahuje predpripravené ready-to-use kartridže spĺňajúce špecifikácie verzie 3 pre sekvenovanie NGS knižníc na prístroji MiSeq s možnosťou párového čítania minimálne 2x75 bp. Maximálny počet čítaní až 25 miliónov, maximálny výstup 3,8 Gb., Hodnota / charakteristika: Set obsahuje reagencie potrebné ku kvantifikácii vzoriek DNA potrebných k NGS analýzam. ; Technické vlastnosti: 1. Sekvenačný kit pre platformu NGS, masívne paralelné sekvenovanie. Reagencie musia byť kompatibilné so zariadením na fluorometrické stanovenie kvantity DNA zariadením Quantus™ Fluorometer. , Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 2. PCR plasty Špecifikácia:PCR plasty – platne (96x0,2ml), stripy 8x0,2ml, DNA LoBind skúmavky-0,5ml, špice s filtrom(10µl, 30µl, 100 µl, 200 µl, 1000 µl), optické vrchnáky na 96 jamkové platne pre bežné laboratórne metodické postupy, využiteľné pri všetkých technológiách spojených s masívnym paralelným sekvenovaním. , Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 3. Prístroj na fragmentáciu DNA. Špecifikácia: Zariadenie je určené na fragmentáciu DNA na downstream NGS analýzy, ktoré vyžadujú fragmenty o veľkosti 150-5000 bázových párov. Zariadenie používa širokú škálu DNA fragmentačných protokolov, má zabudovanú vnútornú kontrolu teploty, nevyžaduje externý chladič. Obsahuje akustický blok, a plne integrovanú termoelektrickú kontrolu. Teplota je udržiavaná v rozpätí +/- 1 oC. Na prenos akustickej energie do vzorky je potrebných 15 ml AFA-grade vody., Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 3. Prístroj na fragmentáciu DNA. Špecifikácia: Zariadenie obsahuje predprogramované protokoly pre bežne používané aplikácie, zahrňujúce fragmentačné protokoly pre 50 a 130 μl vzorky a pre veľkosti fragmentov od 100 do 5000 bp ako aj protokol na fragmentáciu chromatínu. , Hodnota / charakteristika: ; Technické vlastnosti: 3. Prístroj na fragmentáciu DNA. Špecifikácia: Softvér poskytuje real-time zobrazenie parametrov akustickej úpravy vzorky ako je teplota kúpeľa, priemerný výkon, stav prístroja a uplynulý/zostávajúci čas spracovania vzorky. Všetky parametre týkajúce sa spracovania vzoriek (čas a dátum, meno používateľa, AFA nastavenia, teplota, výkon a poznámky ku vzorkám) sú zaznamenávané. Súčasťou dodávky je štartovací set spotrebného materiálu. Súčasťou dodávky je doprava, inštalácia a zaškolenie., Hodnota / charakteristika:

Technická špecifikácia číselná

Technické vlastnosti: 1. Sekvenačný kit pre platformu NGS, masívne paralelné sekvenovanie. , Jednotka: kit, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 7; Technické vlastnosti: 2. PCR plasty, Jednotka: balenie, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 40; Technické vlastnosti: 3. Prístroj na fragmentáciu DNA, Jednotka: kus, Minimum: , Maximum: , Presná hodnota: 1