Funkčná špecifikácia
1. Polymér pre genetický analyzátor ABI 3500, 3 ks: -nosičový polymér ako výplň tenkých kapilár; - vhodný na sekvenačnú a fragmentáčnú analýzu, kompatibilný s genet. analyzátorom ABI 3500 - 1 bal.= min 380 behov; 2. Sekvenačný kit pre ABI 3500 Genetic Analyzer, 2ks: - Kit na dideoxysekvenačnú analýzu pomocou lineárnej PCR s fluorescenčne značenými dideoxynukleotidmi; - verzia na kratšie fragmenty; - 1kit = 100 reakcií; 3. Jednorázovo použiteľný umelohmotný kontajner s katódovým pufrom pre kapilárovú elektroforézu, 2 bal.: - kompatibilné s genetickým analyzátorom ABI 3500; - 1 bal.=4kontainery; 4. Jednorázovo použiteľný umelohmotný kontajner s anódovým pufrom pre kapilárovú elektroforézu, 2 bal.: - kompatibilný s genetickým analyzátorom ABI 3500; - 1bal.=4kontainery; 5. Primery, 400 báz: - syntetické oligonukleotidy, lyofilizované, odsolené; -koncentrácia 0,05 µmol; 6. GoTaq G2 Hot Start Polymerase, Promega, 1 bal.: - polymeráza s úpravou “hot start”, so zvýšenou špecificitou pri amplifikácii, može minimalizovať vznik primer-dimérov a nešpecifických produktov; - polymeráza má 5’→ 3’ exonukleázovú aktivitu; - balenie obsahuje polymerázu, dva druhy pufrov bez obsahu MgCl2, a samostatnú skúmavku s MgCl2; - 1 bal.=500U; 7. Fluorescenčná farbička na nukleové kyseliny, 1ks (0,5ml): - Citlivé, stabilné a ekologicky bezpečné fluorescenčné farbivo na nukleové kyseliny navrhnuté tak, aby nahradilo vysoko toxický etídiumbromid (EtBr) na farbenie dsDNA, ssDNA alebo RNA v agarózovom alebo polyakrylamidovom géli.; 8. Nanášacia farbička na agarózový gél, 1 bal.: - 6x koncentrovaná DNA nanášacia farbička odporúčaná na analýzu DNA vzoriek pomocou agarózovej elektroforézy alebo PAGE; - obsahuje brómfenolovú modrú a xyléncyanol FF; - 1 bal.= 5x1ml; 9. Hmotnostný štandard 100bp, 1ks: -chromatografiou purifikovaný DNA rebríček, ktorý je zmesou individuálnych DNA fragmentov od 100-1000bp; -1bal.=5x50 ug; 10. Kit na purifikáciu PCR produktov z gélu a purifikáciu PCR produktov, 1 bal.: -kit využíva kolónky s technológiou silica-membránok, používa sa na purifikáciu PCR produktov, extrakciu DNA z agarózových a polyakrylamidových gélov; -umožňuje prečisťovanie jednovláknovej DNA a RNA extrakciu z agarózových gélov; -typické aplikácie: klonovanie, sekvenovanie, PCR a restrikčná analýza; -umožňuje odstránenie nukleotidov, primerov, enzýmov, minerálneho oleja, PCR aditív, farbičiek a detergentov; - 1bal.=250rxn; 11. Kit na purifikáciu sekvenačných reakcií, 3 bal.: - Špecifický kolónkový systém umožňujúci rýchle a efektívne odstránenie malých molekúl vrátane neinkorporovaných farebne značených nukleotidov, primerov, solí a ďalších interferujúcich komponentov zo sekvenačnej reakcie; - Kolónky sú tiež určené na prečistenie PCR reakcií; - Umožňuje purifikáciu aj zo sekvenačných reakcií, v ktorých bol použitý BigDye v3.1;; - Kolónky obsahujú gélovú matrix, ktorá selektívne absorbuje malé molekuly a zároveň poskytuje maximálne výťažky jedno a dvojvláknovej DNA dlhšej ako 20bp;- Objem prečisťovanej vzorky musí byť až do 100µl;- 1bal.=70rxn; 12. Reagencie na rýchle čistenie PCR reakcií, 100 reakcií, 2 bal: - Rýchle čistenie PCR reakcií od nespotrebovaných dNTP a primerov pre následné aplikácie, ako sekvenovanie DNA alebo analýza SNP. Hydrolytické enzýmy ako exonukleáza I a alkalickú fosfatázu z kreviet (SAP) sa pridajú priamo do produktu PCR a inkubuje sa pri 37 ° C počas 15 minút a inaktivuje sa zahrievaním na 80 ° C počas 15 minút.; - 1 bal.=100rxns; 13. Etylalkohol 99,8% absolútny, 1L, 2 bal.; 14. Sterilizačná kontrolná páska (19mmx50m), 1 bal.: Obsahuje termoaktívne pigmenty. Biele pásiky s pigmentami po autoklávovaní zhnednú (121°C 20min, 134°C 5 min); 15. Ultračisté 0,5M EDTA s pH 8.0 (4x100ml), 1 bal.: - vodný roztok pripravený rozpustením Na2EDTA • 2H20 v destilovanej, deionizovanej vode a úpravou pH na 8,0 hydroxidom sodným. Tento sterilne filtrovaný roztok je vhodný pre biochemické alebo molekulárne biologické aplikácie, ktoré vyžadujú chelátor dvojmocných kovových iónov.; - 1bal.=4x100ml; 16. Primery, 400 báz: - syntetické oligonukleotidy, lyofilizované, odsolené; -koncentrácia 0,05 µmol; 17. GoTaq G2 Hot Start Polymerase, Promega, 1 bal.: - polymeráza s úpravou “hot start”, so zvýšenou špecificitou pri amplifikácii, može minimalizovať vznik primer-dimérov a nešpecifických produktov; - polymeráza má 5’→ 3’ exonukleázovú aktivitu; - balenie obsahuje polymerázu, dva druhy pufrov bez obsahu MgCl2, a samostatnú skúmavku s MgCl2; - 1 bal.=500U; 18. TaqMan SNP Genotyping Assay, 3 bal.: - určené na genotypizáciu jednonukleotidových polymorfizmov; - kompatibilné so 7500 Fast Real Time PCR systémom od Applied Biosystems; - 1bal.=188µl;; 19. Master mix na SNP genotypizáciu použiteľný s TaqMan próbami, 10ml, 1 bal: - 2x koncentrovaný real-time PCR master mix je optimalizovaný na detekciu koncovej (end-point) fluorescencie pri aplikáciách SNP genotypizácie, obsahuje ultračistú AmpliTaq Gold DNA polymerázu, dNTP bez dUTP, farbičku pasívnej referencie - ROX a ďalšie optimalizované komponenty. Aplikovateľný pre alelickú diskrimináciu a plne kompatibilný s TaqMan SNP Genotyping Assay a prístrojom 7500 Fast Real-Time PCR System.; - 1bal.= 10ml (400rxns); 20. Master mix na génovú expresiu použiteľný s TaqMan próbami, 5ml, 1bal: - 2x koncentrovaný real-time PCR master mix optimalizovaný na kvantitatívnu detekciu génovej expresie, detekciu zriedkavých transkriptov, patogénov, amplifikáciu dvoch terčových molekúl. Master mix obsahuje ultračistú AmpliTaq Gold DNA polymerázu, dNTP s dTTP/dUTP, Uracil-DNA glykozylázu, farbičku pasívnej referencie - ROX a ďalšie optimalizované komponenty. Master mix je plne kompatibilný s TaqMan Gene Expression Assays a prístrojom 7500 Fast Real-Time PCR System.; - 1bal.= 5ml (200rxns); 21. mirVana miRNA isolation kit, with phenol, 1 bal., resp. plnohodnotný ekvivalent: - kit určný na izoláciu malých RNA z krvi, tkaniva, plazmy; - finálny produkt: total RNA, miRNA, siRNA, snRNA, snoRNA; - izolačná techológia: organická extrakcia, kolónková technológia (Glass Fiber Filter); - 1 bal.=40 izolácií; 22. Kyselina Boritá, Bioreagent, 500g, 1 bal.: - pre aplikácie v molekulárnej biológii (ako súčasť pufra na elektroforézu), vhodná pre bunkové kultúry a rastlinné kultúry s obsahom čistej látky ≥99.5%.; - 1 bal.=500g; 23. Tris (hydroxymetyl)aminometán, ACS reagent, 500g, 1 bal.: - potrebný pre prípravu pufrových roztokov s fyziologickým pH 7,3-7,5 kompatibilných s biologickými tekutinami s obsahom čistej látky ≥99.8%; - 1 bal.=500g
Technická špecifikácia textová
Technická špecifikácia číselná